Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCNT4Q9P109 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms