Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM4Q9C037 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms