Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PIK3IP1Q96FE7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3IP1Q96FE7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms