Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIK3IP1Q96FE7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3IP1Q96FE7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3IP1Q96FE7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3IP1Q96FE7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3IP1Q96FE7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3IP1Q96FE7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3IP1Q96FE7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3IP1Q96FE7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3IP1Q96FE7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3IP1Q96FE7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3IP1Q96FE7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3IP1Q96FE7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3IP1Q96FE7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3IP1Q96FE7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3IP1Q96FE7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3IP1Q96FE7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3IP1Q96FE7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3IP1Q96FE7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3IP1Q96FE7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3IP1Q96FE7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3IP1Q96FE7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3IP1Q96FE7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3IP1Q96FE7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3IP1Q96FE7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3IP1Q96FE7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3IP1Q96FE7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3IP1Q96FE7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3IP1Q96FE7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3IP1Q96FE7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3IP1Q96FE7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3IP1Q96FE7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3IP1Q96FE7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3IP1Q96FE7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3IP1Q96FE7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIK3IP1Q96FE7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3IP1Q96FE7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3IP1Q96FE7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3IP1Q96FE7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3IP1Q96FE7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3IP1Q96FE7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIK3IP1Q96FE7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PIK3IP1Q96FE7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3IP1Q96FE7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3IP1Q96FE7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3IP1Q96FE7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3IP1Q96FE7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3IP1Q96FE7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3IP1Q96FE7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIK3IP1Q96FE7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3IP1Q96FE7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3IP1Q96FE7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3IP1Q96FE7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3IP1Q96FE7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3IP1Q96FE7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3IP1Q96FE7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3IP1Q96FE7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3IP1Q96FE7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3IP1Q96FE7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3IP1Q96FE7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIK3IP1Q96FE7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIK3IP1Q96FE7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3IP1Q96FE7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3IP1Q96FE7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3IP1Q96FE7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3IP1Q96FE7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3IP1Q96FE7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3IP1Q96FE7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3IP1Q96FE7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3IP1Q96FE7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3IP1Q96FE7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3IP1Q96FE7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3IP1Q96FE7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3IP1Q96FE7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3IP1Q96FE7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3IP1Q96FE7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3IP1Q96FE7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3IP1Q96FE7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3IP1Q96FE7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3IP1Q96FE7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3IP1Q96FE7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3IP1Q96FE7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3IP1Q96FE7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3IP1Q96FE7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3IP1Q96FE7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3IP1Q96FE7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3IP1Q96FE7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3IP1Q96FE7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3IP1Q96FE7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3IP1Q96FE7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3IP1Q96FE7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3IP1Q96FE7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3IP1Q96FE7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3IP1Q96FE7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3IP1Q96FE7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3IP1Q96FE7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3IP1Q96FE7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3IP1Q96FE7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3IP1Q96FE7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3IP1Q96FE7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms