Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC50Q8IVM0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms