Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD276Q5ZPR3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD276Q5ZPR3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD276Q5ZPR3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD276Q5ZPR3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD276Q5ZPR3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD276Q5ZPR3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD276Q5ZPR3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD276Q5ZPR3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD276Q5ZPR3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD276Q5ZPR3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD276Q5ZPR3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD276Q5ZPR3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms