Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC1Q5TB30 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms