Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFYVE27Q5T4F4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFYVE27Q5T4F4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms