Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HKDC1Q2TB90 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKDC1Q2TB90 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms