Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CSPP1Q1MSJ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSPP1Q1MSJ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms