Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFBQ13951 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFBQ13951 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFBQ13951 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFBQ13951 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFBQ13951 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFBQ13951 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBFBQ13951 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBFBQ13951 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBFBQ13951 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CBFBQ13951 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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