Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEUROD1Q13562 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEUROD1Q13562 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
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