Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.18e-13■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.873e-11■■□□□ 12
GRSF1Q12849 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.344e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.714e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.464e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 STAT5B-203ENST00000468312 1799 ntTSL 1 (best)22.79■■□□□ 1.244e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CDV3-204ENST00000503932 563 ntTSL 422.76■■□□□ 1.233e-11■■□□□ 12
GRSF1Q12849 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 322.15■■□□□ 1.144e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.971e-8■■□□□ 12
GRSF1Q12849 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.954e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 MZT2B-206ENST00000480182 480 ntTSL 1 (best)20.15■□□□□ 0.824e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.783e-11■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-208ENST00000563386 590 ntTSL 419.87■□□□□ 0.774e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.744e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-205ENST00000562743 888 ntTSL 219.59■□□□□ 0.734e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.681e-8■■□□□ 12
GRSF1Q12849 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 518.72■□□□□ 0.594e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.584e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-210ENST00000563892 570 ntTSL 318.43■□□□□ 0.544e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-203ENST00000562092 254 ntTSL 518.43■□□□□ 0.544e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 MZT2B-203ENST00000425361 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.17■□□□□ 0.54e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 MZT2B-204ENST00000455239 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.1■□□□□ 0.494e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.474e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 317.87■□□□□ 0.454e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-204ENST00000562283 569 ntTSL 417.66■□□□□ 0.424e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.334e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.31e-8■■□□□ 12
GRSF1Q12849 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.274e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CTSA-207ENST00000484855 2183 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.24e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.194e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 MRFAP1-204ENST00000512914 1982 nt16.03■□□□□ 0.161e-8■■□□□ 12
GRSF1Q12849 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-8■■□□□ 12
GRSF1Q12849 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.14e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.094e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)15.22■□□□□ 0.034e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.024e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CTSA-214ENST00000606788 3056 ntTSL 215.06■□□□□ 04e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 SH3BP4-205ENST00000444916 570 ntTSL 414.89□□□□□ -0.034e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.044e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 MZT2B-205ENST00000457492 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.76□□□□□ -0.054e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.134e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CTSA-210ENST00000606000 644 ntTSL 312.96□□□□□ -0.334e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-207ENST00000563048 1315 ntTSL 212.75□□□□□ -0.374e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-8■■□□□ 12
GRSF1Q12849 THOC3-203ENST00000505969 683 ntTSL 512.12□□□□□ -0.474e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CTSA-209ENST00000493522 901 ntTSL 211.98□□□□□ -0.494e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-202ENST00000540269 3070 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.54e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.514e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 THOC3-210ENST00000514861 628 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.534e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-215ENST00000569038 730 ntTSL 311.72□□□□□ -0.534e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 RANGAP1-202ENST00000405486 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-8■■□□□ 12
GRSF1Q12849 SH3BP4-206ENST00000446904 829 ntTSL 311.03□□□□□ -0.644e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 210.87□□□□□ -0.674e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 CTSA-215ENST00000607187 509 ntTSL 210.48□□□□□ -0.734e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 RANGAP1-207ENST00000455915 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.751e-8■■□□□ 12
GRSF1Q12849 THOC3-202ENST00000432305 453 ntTSL 29.8□□□□□ -0.844e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 SH3BP4-207ENST00000454947 500 ntTSL 49.59□□□□□ -0.874e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 STAT5B-202ENST00000415845 559 ntTSL 46.86□□□□□ -1.314e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.324e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-206ENST00000563023 574 ntTSL 45.54□□□□□ -1.524e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-218ENST00000570053 502 ntTSL 34.63□□□□□ -1.674e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 USP10-213ENST00000566512 575 ntTSL 23.27□□□□□ -1.894e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 THOC3-211ENST00000515016 250 ntTSL 32.06□□□□□ -2.084e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-8■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.593e-13■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.196e-6■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.276e-6■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 LAMB2-217ENST00000498377 1021 ntTSL 217.58■□□□□ 0.43e-15■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-15■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 LAMB2-205ENST00000467506 689 ntTSL 214.09□□□□□ -0.153e-15■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.293e-15■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.47e-8■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 410.82□□□□□ -0.687e-8■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.139e-8■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 FADS2-213ENST00000523235 5073 ntTSL 214.63□□□□□ -0.079e-8■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.099e-8■■□□□ 11.9
GRSF1Q12849 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.055e-11■■□□□ 11.8
GRSF1Q12849 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.65e-11■■□□□ 11.8
GRSF1Q12849 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.365e-11■■□□□ 11.8
GRSF1Q12849 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-11■■□□□ 11.8
GRSF1Q12849 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.256e-7■■□□□ 11.8
GRSF1Q12849 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.976e-7■■□□□ 11.8
GRSF1Q12849 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.516e-7■■□□□ 11.8
GRSF1Q12849 NADK2-208ENST00000511088 579 ntTSL 48.83□□□□□ -16e-7■■□□□ 11.8
GRSF1Q12849 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.026e-7■■□□□ 11.8
GRSF1Q12849 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.357e-12■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.587e-12■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.312e-15■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.332e-15■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 518.83■□□□□ 0.62e-15■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 KHSRP-203ENST00000594745 379 ntTSL 315.53■□□□□ 0.082e-15■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 KHSRP-208ENST00000597656 328 ntTSL 58.62□□□□□ -1.032e-15■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.374e-10■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 USO1-204ENST00000514213 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.694e-10■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)21.76■■□□□ 1.072e-8■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-8■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 COL27A1-205ENST00000485397 463 ntTSL 520.62■□□□□ 0.891e-11■■□□□ 11.7
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