Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1DQ01668 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1DQ01668 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1DQ01668 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms