Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CACNA1DQ01668 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CACNA1DQ01668 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNA1DQ01668 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA1DQ01668 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA1DQ01668 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA1DQ01668 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1DQ01668 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA1DQ01668 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA1DQ01668 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1DQ01668 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNA1DQ01668 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1DQ01668 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1DQ01668 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA1DQ01668 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1DQ01668 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA1DQ01668 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1DQ01668 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1DQ01668 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA1DQ01668 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1DQ01668 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1DQ01668 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1DQ01668 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1DQ01668 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1DQ01668 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1DQ01668 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1DQ01668 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1DQ01668 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1DQ01668 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1DQ01668 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1DQ01668 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1DQ01668 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1DQ01668 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1DQ01668 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1DQ01668 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1DQ01668 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA1DQ01668 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1DQ01668 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1DQ01668 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1DQ01668 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1DQ01668 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1DQ01668 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1DQ01668 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1DQ01668 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1DQ01668 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1DQ01668 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1DQ01668 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA1DQ01668 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1DQ01668 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA1DQ01668 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1DQ01668 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA1DQ01668 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA1DQ01668 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1DQ01668 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1DQ01668 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1DQ01668 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1DQ01668 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1DQ01668 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1DQ01668 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1DQ01668 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1DQ01668 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1DQ01668 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1DQ01668 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1DQ01668 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1DQ01668 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1DQ01668 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CACNA1DQ01668 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1DQ01668 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1DQ01668 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1DQ01668 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1DQ01668 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1DQ01668 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1DQ01668 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA1DQ01668 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA1DQ01668 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1DQ01668 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1DQ01668 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA1DQ01668 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1DQ01668 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1DQ01668 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1DQ01668 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1DQ01668 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA1DQ01668 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1DQ01668 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1DQ01668 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1DQ01668 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1DQ01668 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1DQ01668 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1DQ01668 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1DQ01668 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1DQ01668 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1DQ01668 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA1DQ01668 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1DQ01668 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1DQ01668 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1DQ01668 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CACNA1DQ01668 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1DQ01668 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1DQ01668 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1DQ01668 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms