Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR1P43307 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR1P43307 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR1P43307 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR1P43307 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR1P43307 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSR1P43307 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSR1P43307 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SSR1P43307 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSR1P43307 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SSR1P43307 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSR1P43307 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SSR1P43307 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR1P43307 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR1P43307 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR1P43307 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR1P43307 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR1P43307 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSR1P43307 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSR1P43307 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSR1P43307 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR1P43307 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR1P43307 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR1P43307 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR1P43307 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR1P43307 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR1P43307 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR1P43307 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR1P43307 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR1P43307 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR1P43307 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSR1P43307 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSR1P43307 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSR1P43307 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSR1P43307 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSR1P43307 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSR1P43307 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSR1P43307 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSR1P43307 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSR1P43307 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SSR1P43307 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSR1P43307 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSR1P43307 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSR1P43307 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSR1P43307 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SSR1P43307 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSR1P43307 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSR1P43307 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSR1P43307 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSR1P43307 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSR1P43307 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSR1P43307 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSR1P43307 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSR1P43307 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSR1P43307 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSR1P43307 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSR1P43307 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSR1P43307 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSR1P43307 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSR1P43307 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSR1P43307 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSR1P43307 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSR1P43307 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SSR1P43307 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSR1P43307 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSR1P43307 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSR1P43307 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSR1P43307 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSR1P43307 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSR1P43307 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSR1P43307 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSR1P43307 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSR1P43307 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSR1P43307 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSR1P43307 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSR1P43307 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSR1P43307 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSR1P43307 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSR1P43307 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSR1P43307 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SSR1P43307 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSR1P43307 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SSR1P43307 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSR1P43307 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSR1P43307 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSR1P43307 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SSR1P43307 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms