Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIFP27352 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIFP27352 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIFP27352 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIFP27352 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIFP27352 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIFP27352 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIFP27352 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIFP27352 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIFP27352 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIFP27352 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIFP27352 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIFP27352 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIFP27352 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIFP27352 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIFP27352 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIFP27352 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GIFP27352 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIFP27352 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIFP27352 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIFP27352 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIFP27352 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIFP27352 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIFP27352 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIFP27352 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIFP27352 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIFP27352 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GIFP27352 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GIFP27352 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIFP27352 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIFP27352 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIFP27352 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIFP27352 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIFP27352 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GIFP27352 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIFP27352 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIFP27352 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIFP27352 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GIFP27352 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIFP27352 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIFP27352 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIFP27352 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms