Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GNB3P16520 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GNB3P16520 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GNB3P16520 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
GNB3P16520 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GNB3P16520 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GNB3P16520 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GNB3P16520 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GNB3P16520 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GNB3P16520 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GNB3P16520 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GNB3P16520 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GNB3P16520 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GNB3P16520 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GNB3P16520 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GNB3P16520 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GNB3P16520 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GNB3P16520 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GNB3P16520 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GNB3P16520 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GNB3P16520 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GNB3P16520 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GNB3P16520 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GNB3P16520 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GNB3P16520 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GNB3P16520 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GNB3P16520 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GNB3P16520 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GNB3P16520 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GNB3P16520 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GNB3P16520 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GNB3P16520 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GNB3P16520 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GNB3P16520 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GNB3P16520 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GNB3P16520 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GNB3P16520 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GNB3P16520 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GNB3P16520 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms