Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRATO95237 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRATO95237 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRATO95237 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRATO95237 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRATO95237 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRATO95237 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRATO95237 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRATO95237 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRATO95237 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRATO95237 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRATO95237 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRATO95237 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRATO95237 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRATO95237 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRATO95237 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRATO95237 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRATO95237 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRATO95237 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRATO95237 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRATO95237 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRATO95237 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRATO95237 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRATO95237 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRATO95237 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRATO95237 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRATO95237 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRATO95237 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRATO95237 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRATO95237 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRATO95237 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRATO95237 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRATO95237 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRATO95237 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRATO95237 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRATO95237 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRATO95237 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRATO95237 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRATO95237 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRATO95237 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms