Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TAF11Q15544 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TAF11Q15544 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TAF11Q15544 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TAF11Q15544 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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