Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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