RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.88■■■■□ 3.97
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.4■■■■□ 3.26
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCC9O60706 1549 aa34.8■■■■□ 3.16
PTPRVP-202ENST00000490575 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.32■■■□□ 2.92
PTPRVP-202ENST00000490575 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.31■■■□□ 2.92
PTPRVP-202ENST00000490575 NACADO15069 1562 aa33.27■■■□□ 2.92
PTPRVP-202ENST00000490575 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
PTPRVP-202ENST00000490575 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.03■■■□□ 2.88
PTPRVP-202ENST00000490575 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.91■■■□□ 2.86
PTPRVP-202ENST00000490575 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.77■■■□□ 2.84
PTPRVP-202ENST00000490575 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.54■■■□□ 2.8
PTPRVP-202ENST00000490575 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.49■■■□□ 2.79
PTPRVP-202ENST00000490575 SCRIBQ14160 1630 aa32.41■■■□□ 2.78
PTPRVP-202ENST00000490575 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.1■■■□□ 2.73
PTPRVP-202ENST00000490575 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
PTPRVP-202ENST00000490575 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.46■■■□□ 2.63
PTPRVP-202ENST00000490575 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.2■■■□□ 2.58
PTPRVP-202ENST00000490575 SMARCA4P51532 1647 aa30.96■■■□□ 2.55
PTPRVP-202ENST00000490575 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
PTPRVP-202ENST00000490575 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRVP-202ENST00000490575 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRVP-202ENST00000490575 NCAPD3P42695 1498 aa30.75■■■□□ 2.51
PTPRVP-202ENST00000490575 SMARCA2P51531 1590 aa30.66■■■□□ 2.5
PTPRVP-202ENST00000490575 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.63■■■□□ 2.49
PTPRVP-202ENST00000490575 HMGXB3Q12766 1538 aa30.57■■■□□ 2.48
PTPRVP-202ENST00000490575 WIZO95785 1651 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPRVP-202ENST00000490575 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
PTPRVP-202ENST00000490575 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
PTPRVP-202ENST00000490575 NESP48681 1621 aa30.16■■■□□ 2.42
PTPRVP-202ENST00000490575 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PTPRVP-202ENST00000490575 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.9■■■□□ 2.38
PTPRVP-202ENST00000490575 ERCC6Q03468 1493 aa29.86■■■□□ 2.37
PTPRVP-202ENST00000490575 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.83■■■□□ 2.37
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.78■■■□□ 2.36
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.77■■■□□ 2.36
PTPRVP-202ENST00000490575 CFTRP13569 1480 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRVP-202ENST00000490575 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
PTPRVP-202ENST00000490575 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRVP-202ENST00000490575 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
PTPRVP-202ENST00000490575 CUX2O14529 1486 aa29.55■■■□□ 2.32
PTPRVP-202ENST00000490575 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRVP-202ENST00000490575 PRDM2Q13029 1718 aa29.46■■■□□ 2.31
PTPRVP-202ENST00000490575 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.44■■■□□ 2.3
PTPRVP-202ENST00000490575 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRVP-202ENST00000490575 WDR62O43379 1518 aa29.36■■■□□ 2.29
PTPRVP-202ENST00000490575 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
PTPRVP-202ENST00000490575 TOPBP1Q92547 1522 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPRVP-202ENST00000490575 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29■■■□□ 2.23
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCC8Q09428 1581 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRVP-202ENST00000490575 CUX1P39880 1505 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
PTPRVP-202ENST00000490575 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
PTPRVP-202ENST00000490575 IFT140Q96RY7 1462 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRVP-202ENST00000490575 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PTPRVP-202ENST00000490575 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.77■■■□□ 2.2
PTPRVP-202ENST00000490575 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRVP-202ENST00000490575 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRVP-202ENST00000490575 SOGA1O94964 1423 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
PTPRVP-202ENST00000490575 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.187e-8■■■□□ 18.6
PTPRVP-202ENST00000490575 SYNJ1O43426 1573 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRVP-202ENST00000490575 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.6■■■□□ 2.17
PTPRVP-202ENST00000490575 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.58■■■□□ 2.17
PTPRVP-202ENST00000490575 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TOP2BQ02880 1626 aa28.57■■■□□ 2.16
PTPRVP-202ENST00000490575 WDR97A6NE52 1622 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.37■■■□□ 2.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CHD1O14646 1710 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRVP-202ENST00000490575 PBRM1Q86U86 1689 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRVP-202ENST00000490575 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRVP-202ENST00000490575 OSCARQ8IYS5 282 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRVP-202ENST00000490575 GRIN2BQ13224 1484 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRVP-202ENST00000490575 FBLN2P98095 1184 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRVP-202ENST00000490575 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PTPRVP-202ENST00000490575 SYNJ2O15056 1496 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRVP-202ENST00000490575 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
PTPRVP-202ENST00000490575 ADAMTS12P58397 1594 aa28.08■■■□□ 2.09
PTPRVP-202ENST00000490575 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.06■■■□□ 2.08
PTPRVP-202ENST00000490575 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.01■■■□□ 2.07
PTPRVP-202ENST00000490575 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28■■■□□ 2.07
PTPRVP-202ENST00000490575 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28■■■□□ 2.07
PTPRVP-202ENST00000490575 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28■■■□□ 2.07
PTPRVP-202ENST00000490575 GRIN2AQ12879 1464 aa27.97■■■□□ 2.07
PTPRVP-202ENST00000490575 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.97■■■□□ 2.07
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGEF11O15085 1522 aa27.95■■■□□ 2.06
PTPRVP-202ENST00000490575 IGF1RP08069 1367 aa27.95■■■□□ 2.06
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF27Q86VH2 1401 aa27.94■■■□□ 2.06
PTPRVP-202ENST00000490575 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.92■■■□□ 2.06
PTPRVP-202ENST00000490575 CEP170Q5SW79 1584 aa27.92■■■□□ 2.06
PTPRVP-202ENST00000490575 NUP160Q12769 1436 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRVP-202ENST00000490575 TRIM41Q8WV44 630 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRVP-202ENST00000490575 CUL7Q14999 1698 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRVP-202ENST00000490575 ARAP1Q96P48 1450 aa27.76■■■□□ 2.04
PTPRVP-202ENST00000490575 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.74■■■□□ 2.03
PTPRVP-202ENST00000490575 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.73■■■□□ 2.03
PTPRVP-202ENST00000490575 SHROOM2Q13796 1616 aa27.68■■■□□ 2.02
PTPRVP-202ENST00000490575 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.68■■■□□ 2.02
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