Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMB3Q13751 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMB3Q13751 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMB3Q13751 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LAMB3Q13751 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMB3Q13751 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LAMB3Q13751 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LAMB3Q13751 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
LAMB3Q13751 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LAMB3Q13751 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LAMB3Q13751 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMB3Q13751 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMB3Q13751 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LAMB3Q13751 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LAMB3Q13751 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LAMB3Q13751 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LAMB3Q13751 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMB3Q13751 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LAMB3Q13751 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMB3Q13751 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMB3Q13751 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LAMB3Q13751 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMB3Q13751 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMB3Q13751 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LAMB3Q13751 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LAMB3Q13751 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LAMB3Q13751 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LAMB3Q13751 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LAMB3Q13751 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LAMB3Q13751 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMB3Q13751 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMB3Q13751 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMB3Q13751 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LAMB3Q13751 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMB3Q13751 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMB3Q13751 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMB3Q13751 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMB3Q13751 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMB3Q13751 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMB3Q13751 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LAMB3Q13751 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMB3Q13751 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMB3Q13751 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMB3Q13751 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LAMB3Q13751 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMB3Q13751 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMB3Q13751 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMB3Q13751 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMB3Q13751 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMB3Q13751 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMB3Q13751 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMB3Q13751 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMB3Q13751 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMB3Q13751 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMB3Q13751 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMB3Q13751 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMB3Q13751 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMB3Q13751 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMB3Q13751 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMB3Q13751 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMB3Q13751 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMB3Q13751 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMB3Q13751 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMB3Q13751 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMB3Q13751 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMB3Q13751 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LAMB3Q13751 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMB3Q13751 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMB3Q13751 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMB3Q13751 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMB3Q13751 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMB3Q13751 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMB3Q13751 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMB3Q13751 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMB3Q13751 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMB3Q13751 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB3Q13751 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMB3Q13751 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB3Q13751 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB3Q13751 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB3Q13751 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB3Q13751 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB3Q13751 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMB3Q13751 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB3Q13751 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMB3Q13751 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMB3Q13751 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMB3Q13751 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMB3Q13751 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMB3Q13751 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMB3Q13751 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB3Q13751 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB3Q13751 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMB3Q13751 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB3Q13751 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB3Q13751 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMB3Q13751 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMB3Q13751 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMB3Q13751 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB3Q13751 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
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