Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms