Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms