Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RETNLBQ9BQ08 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RETNLBQ9BQ08 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RETNLBQ9BQ08 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RETNLBQ9BQ08 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RETNLBQ9BQ08 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RETNLBQ9BQ08 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RETNLBQ9BQ08 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RETNLBQ9BQ08 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RETNLBQ9BQ08 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RETNLBQ9BQ08 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RETNLBQ9BQ08 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RETNLBQ9BQ08 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RETNLBQ9BQ08 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RETNLBQ9BQ08 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RETNLBQ9BQ08 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RETNLBQ9BQ08 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RETNLBQ9BQ08 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RETNLBQ9BQ08 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RETNLBQ9BQ08 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RETNLBQ9BQ08 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RETNLBQ9BQ08 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RETNLBQ9BQ08 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RETNLBQ9BQ08 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RETNLBQ9BQ08 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RETNLBQ9BQ08 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RETNLBQ9BQ08 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RETNLBQ9BQ08 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RETNLBQ9BQ08 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RETNLBQ9BQ08 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RETNLBQ9BQ08 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RETNLBQ9BQ08 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RETNLBQ9BQ08 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RETNLBQ9BQ08 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RETNLBQ9BQ08 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RETNLBQ9BQ08 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RETNLBQ9BQ08 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RETNLBQ9BQ08 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RETNLBQ9BQ08 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RETNLBQ9BQ08 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RETNLBQ9BQ08 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RETNLBQ9BQ08 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RETNLBQ9BQ08 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RETNLBQ9BQ08 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RETNLBQ9BQ08 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RETNLBQ9BQ08 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RETNLBQ9BQ08 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RETNLBQ9BQ08 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RETNLBQ9BQ08 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RETNLBQ9BQ08 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RETNLBQ9BQ08 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RETNLBQ9BQ08 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RETNLBQ9BQ08 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RETNLBQ9BQ08 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RETNLBQ9BQ08 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RETNLBQ9BQ08 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RETNLBQ9BQ08 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RETNLBQ9BQ08 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RETNLBQ9BQ08 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RETNLBQ9BQ08 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RETNLBQ9BQ08 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RETNLBQ9BQ08 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RETNLBQ9BQ08 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RETNLBQ9BQ08 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RETNLBQ9BQ08 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RETNLBQ9BQ08 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RETNLBQ9BQ08 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RETNLBQ9BQ08 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RETNLBQ9BQ08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RETNLBQ9BQ08 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RETNLBQ9BQ08 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RETNLBQ9BQ08 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RETNLBQ9BQ08 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RETNLBQ9BQ08 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RETNLBQ9BQ08 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RETNLBQ9BQ08 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RETNLBQ9BQ08 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RETNLBQ9BQ08 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RETNLBQ9BQ08 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RETNLBQ9BQ08 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RETNLBQ9BQ08 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RETNLBQ9BQ08 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RETNLBQ9BQ08 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RETNLBQ9BQ08 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RETNLBQ9BQ08 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RETNLBQ9BQ08 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RETNLBQ9BQ08 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RETNLBQ9BQ08 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RETNLBQ9BQ08 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RETNLBQ9BQ08 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RETNLBQ9BQ08 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RETNLBQ9BQ08 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RETNLBQ9BQ08 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RETNLBQ9BQ08 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RETNLBQ9BQ08 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RETNLBQ9BQ08 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms