Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ASB11-202ENST00000380470 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN30-211ENST00000610712 3439 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PADI4-201ENST00000375448 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms