Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3GL3Q99963 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL3Q99963 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms