Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms