Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms