Protein–RNA interactions for Protein: Q12798

CETN1, Centrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETN1Q12798 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CETN1Q12798 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms