Protein–RNA interactions for Protein: Q12798

CETN1, Centrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETN1Q12798 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CETN1Q12798 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CETN1Q12798 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CETN1Q12798 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CETN1Q12798 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CETN1Q12798 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CETN1Q12798 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CETN1Q12798 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CETN1Q12798 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CETN1Q12798 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CETN1Q12798 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CETN1Q12798 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CETN1Q12798 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CETN1Q12798 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CETN1Q12798 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CETN1Q12798 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CETN1Q12798 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CETN1Q12798 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CETN1Q12798 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CETN1Q12798 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CETN1Q12798 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CETN1Q12798 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CETN1Q12798 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CETN1Q12798 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CETN1Q12798 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CETN1Q12798 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CETN1Q12798 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CETN1Q12798 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CETN1Q12798 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CETN1Q12798 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CETN1Q12798 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CETN1Q12798 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CETN1Q12798 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CETN1Q12798 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CETN1Q12798 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CETN1Q12798 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CETN1Q12798 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CETN1Q12798 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CETN1Q12798 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CETN1Q12798 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CETN1Q12798 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CETN1Q12798 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CETN1Q12798 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CETN1Q12798 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CETN1Q12798 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CETN1Q12798 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CETN1Q12798 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CETN1Q12798 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CETN1Q12798 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CETN1Q12798 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CETN1Q12798 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CETN1Q12798 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CETN1Q12798 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CETN1Q12798 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CETN1Q12798 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CETN1Q12798 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CETN1Q12798 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CETN1Q12798 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CETN1Q12798 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CETN1Q12798 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CETN1Q12798 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CETN1Q12798 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CETN1Q12798 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CETN1Q12798 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CETN1Q12798 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CETN1Q12798 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CETN1Q12798 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CETN1Q12798 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CETN1Q12798 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CETN1Q12798 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CETN1Q12798 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CETN1Q12798 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
CETN1Q12798 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CETN1Q12798 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CETN1Q12798 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CETN1Q12798 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CETN1Q12798 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CETN1Q12798 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CETN1Q12798 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CETN1Q12798 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CETN1Q12798 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CETN1Q12798 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CETN1Q12798 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CETN1Q12798 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CETN1Q12798 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CETN1Q12798 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CETN1Q12798 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CETN1Q12798 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CETN1Q12798 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CETN1Q12798 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CETN1Q12798 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CETN1Q12798 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CETN1Q12798 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CETN1Q12798 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CETN1Q12798 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CETN1Q12798 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CETN1Q12798 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CETN1Q12798 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CETN1Q12798 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CETN1Q12798 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms