Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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