Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXD4Q12950 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXD4Q12950 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXD4Q12950 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXD4Q12950 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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