Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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