Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ALKQ9UM73 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ALKQ9UM73 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ALKQ9UM73 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms