Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP4Q9P0V3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms