Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 27.7
AATFQ9NY61 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 27.7
AATFQ9NY61 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 27.7
AATFQ9NY61 RPL23A-208ENST00000580755 412 ntTSL 219.58■□□□□ 0.728e-28■■■■■ 27.7
AATFQ9NY61 RPS13-207ENST00000531008 594 ntTSL 23.71□□□□□ -1.821e-21■■■■■ 27.6
AATFQ9NY61 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.011e-21■■■■■ 27.6
AATFQ9NY61 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 311.8□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 27.5
AATFQ9NY61 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 27.5
AATFQ9NY61 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.027e-6■■■■■ 27.5
AATFQ9NY61 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.5
AATFQ9NY61 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.37e-6■■■■■ 27.5
AATFQ9NY61 NFE2L1-219ENST00000584137 529 ntTSL 427.58■■■□□ 2.011e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-216ENST00000583060 477 ntTSL 324.11■■□□□ 1.451e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-223ENST00000585299 537 ntTSL 420.49■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-215ENST00000582574 556 ntTSL 319.94■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-207ENST00000579481 564 ntTSL 219.77■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-221ENST00000585062 556 ntTSL 419.54■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-213ENST00000581441 552 ntTSL 415.76■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-209ENST00000579889 568 ntTSL 315.53■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 27.4
AATFQ9NY61 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.913e-6■■■■■ 27.2
AATFQ9NY61 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 27.2
AATFQ9NY61 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 27.2
AATFQ9NY61 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 519.83■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 27.2
AATFQ9NY61 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 27.2
AATFQ9NY61 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 27.1
AATFQ9NY61 RPL7A-209ENST00000496554 947 ntTSL 221.94■■□□□ 1.13e-32■■■■■ 27
AATFQ9NY61 TRIM28-215ENST00000601150 915 ntTSL 320.48■□□□□ 0.873e-7■■■■□ 26.6
AATFQ9NY61 TRIM28-207ENST00000597136 1552 ntTSL 218.15■□□□□ 0.53e-7■■■■□ 26.6
AATFQ9NY61 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 216.2■□□□□ 0.181e-72■■■■□ 26.6
AATFQ9NY61 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.21e-72■■■■□ 26.6
AATFQ9NY61 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.34□□□□□ -2.361e-323■■■■□ 26.5
AATFQ9NY61 EIF4A2-218ENST00000475653 909 ntTSL 27.63□□□□□ -1.198e-17■■■■□ 26.4
AATFQ9NY61 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.064e-7■■■■□ 26.4
AATFQ9NY61 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)19.45■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-208ENST00000587361 579 ntTSL 328.02■■■□□ 2.086e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.826e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.686e-7■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.566e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 523.13■■□□□ 1.296e-7■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-212ENST00000589644 1917 ntTSL 222.55■■□□□ 1.26e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.156e-7■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-205ENST00000585563 1118 ntTSL 321.68■■□□□ 1.066e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.066e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 EHMT1-202ENST00000460486 818 ntTSL 520.88■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.926e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 EXD3-212ENST00000491734 2176 ntTSL 1 (best)20.8■□□□□ 0.926e-7■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 EHMT1-219ENST00000626066 1297 ntTSL 520.59■□□□□ 0.892e-6■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.816e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-207ENST00000587039 466 ntTSL 519.47■□□□□ 0.716e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.626e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.536e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 GET4-203ENST00000412734 873 ntTSL 218.17■□□□□ 0.56e-7■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 YIF1B-211ENST00000589247 734 ntTSL 217.93■□□□□ 0.466e-10■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 517.91■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 EXD3-206ENST00000478344 2932 ntTSL 216.63■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 GET4-204ENST00000426056 502 ntTSL 412.73□□□□□ -0.376e-7■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-15■■■■□ 26.1
AATFQ9NY61 SNORD3A-203ENST00000625876 217 nt13.43□□□□□ -0.261e-323■■■■□ 25.9
AATFQ9NY61 SNORD3A-202ENST00000620232 218 nt13.19□□□□□ -0.31e-323■■■■□ 25.9
AATFQ9NY61 SNORD3A-201ENST00000584923 699 ntBASIC12.64□□□□□ -0.391e-323■■■■□ 25.9
AATFQ9NY61 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)20.02■□□□□ 0.84e-9■■■■□ 25.9
AATFQ9NY61 BBC3-205ENST00000598636 900 ntTSL 229■■■□□ 2.232e-6■■■■□ 25.8
AATFQ9NY61 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.761e-9■■■■□ 25.7
AATFQ9NY61 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-9■■■■□ 25.7
AATFQ9NY61 CCT6A-208ENST00000493855 261 ntTSL 22.51□□□□□ -2.011e-9■■■■□ 25.7
AATFQ9NY61 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.28□□□□□ -2.361e-9■■■■□ 25.7
AATFQ9NY61 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.15e-8■■■■□ 25.7
AATFQ9NY61 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.65e-8■■■■□ 25.7
AATFQ9NY61 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.525e-8■■■■□ 25.7
AATFQ9NY61 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.655e-8■■■■□ 25.7
AATFQ9NY61 TCF25-226ENST00000640279 2688 ntTSL 518.03■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 25.7
AATFQ9NY61 VPS28-206ENST00000526734 570 ntTSL 225.1■■□□□ 1.616e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-212ENST00000530836 1613 ntTSL 525.05■■□□□ 1.66e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-208ENST00000527797 1609 ntTSL 525.01■■□□□ 1.596e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-209ENST00000528142 1821 ntTSL 324.31■■□□□ 1.486e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-205ENST00000526204 2120 ntTSL 524.29■■□□□ 1.486e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-207ENST00000526977 2036 ntTSL 522.35■■□□□ 1.176e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-213ENST00000530983 2337 ntTSL 521.98■■□□□ 1.116e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-215ENST00000531924 695 ntTSL 318.04■□□□□ 0.486e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-216ENST00000533806 650 ntTSL 315.78■□□□□ 0.126e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-214ENST00000531032 573 ntTSL 1 (best)13.93□□□□□ -0.186e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 VPS28-204ENST00000526054 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.446e-6■■■■□ 25.6
AATFQ9NY61 TELO2-202ENST00000497339 1667 ntTSL 524.85■■□□□ 1.576e-11■■■■□ 25.5
AATFQ9NY61 TELO2-206ENST00000567427 634 ntTSL 324.44■■□□□ 1.56e-11■■■■□ 25.5
AATFQ9NY61 TELO2-208ENST00000569744 575 ntTSL 521.44■■□□□ 1.026e-11■■■■□ 25.5
AATFQ9NY61 TELO2-203ENST00000563676 555 ntTSL 220.53■□□□□ 0.886e-11■■■■□ 25.5
AATFQ9NY61 TELO2-204ENST00000564507 903 ntTSL 317.84■□□□□ 0.456e-11■■■■□ 25.5
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