RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587361.1

YIF1B-208, Transcript of Yip1 interacting factor homolog B, membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 3

Gene YIF1B, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIF1B-208ENST00000587361 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.86■■■■■ 6.69
YIF1B-208ENST00000587361 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.9■■■■■ 5.74
YIF1B-208ENST00000587361 ABCC9O60706 1549 aa50.36■■■■■ 5.65
YIF1B-208ENST00000587361 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.21■■■■■ 5.31
YIF1B-208ENST00000587361 NACADO15069 1562 aa48■■■■■ 5.27
YIF1B-208ENST00000587361 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.7■■■■■ 5.23
YIF1B-208ENST00000587361 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.51■■■■■ 5.2
YIF1B-208ENST00000587361 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
YIF1B-208ENST00000587361 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.11■■■■■ 5.13
YIF1B-208ENST00000587361 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.05■■■■■ 5.12
YIF1B-208ENST00000587361 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.91■■■■■ 5.1
YIF1B-208ENST00000587361 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.81■■■■■ 5.08
YIF1B-208ENST00000587361 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.75■■■■■ 5.07
YIF1B-208ENST00000587361 SCRIBQ14160 1630 aa46.32■■■■■ 5.01
YIF1B-208ENST00000587361 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.27■■■■■ 5
YIF1B-208ENST00000587361 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
YIF1B-208ENST00000587361 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.55■■■■■ 4.88
YIF1B-208ENST00000587361 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.36■■■■■ 4.85
YIF1B-208ENST00000587361 NCAPD3P42695 1498 aa44.28■■■■■ 4.68
YIF1B-208ENST00000587361 SMARCA4P51532 1647 aa44.27■■■■■ 4.68
YIF1B-208ENST00000587361 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.18■■■■■ 4.66
YIF1B-208ENST00000587361 SMARCA2P51531 1590 aa44.14■■■■■ 4.66
YIF1B-208ENST00000587361 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
YIF1B-208ENST00000587361 HMGXB3Q12766 1538 aa44.03■■■■■ 4.64
YIF1B-208ENST00000587361 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.87■■■■■ 4.61
YIF1B-208ENST00000587361 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
YIF1B-208ENST00000587361 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.79■■■■■ 4.6
YIF1B-208ENST00000587361 ERCC6Q03468 1493 aa43.49■■■■■ 4.55
YIF1B-208ENST00000587361 NESP48681 1621 aa43.38■■■■■ 4.54
YIF1B-208ENST00000587361 CUX2O14529 1486 aa43.31■■■■■ 4.52
YIF1B-208ENST00000587361 WIZO95785 1651 aa43.29■■■■■ 4.52
YIF1B-208ENST00000587361 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.24■■■■■ 4.51
YIF1B-208ENST00000587361 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
YIF1B-208ENST00000587361 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.96■■■■■ 4.47
YIF1B-208ENST00000587361 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.94■■■■■ 4.46
YIF1B-208ENST00000587361 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
YIF1B-208ENST00000587361 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.89■■■■■ 4.46
YIF1B-208ENST00000587361 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
YIF1B-208ENST00000587361 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.73■■■■■ 4.43
YIF1B-208ENST00000587361 CFTRP13569 1480 aa42.55■■■■■ 4.4
YIF1B-208ENST00000587361 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.55■■■■■ 4.4
YIF1B-208ENST00000587361 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.47■■■■■ 4.39
YIF1B-208ENST00000587361 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.45■■■■■ 4.39
YIF1B-208ENST00000587361 WDR62O43379 1518 aa42.44■■■■■ 4.38
YIF1B-208ENST00000587361 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.28■■■■■ 4.36
YIF1B-208ENST00000587361 PRDM2Q13029 1718 aa42.23■■■■■ 4.35
YIF1B-208ENST00000587361 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
YIF1B-208ENST00000587361 TOPBP1Q92547 1522 aa41.69■■■■■ 4.27
YIF1B-208ENST00000587361 ABCC8Q09428 1581 aa41.69■■■■■ 4.26
YIF1B-208ENST00000587361 IFT140Q96RY7 1462 aa41.61■■■■■ 4.25
YIF1B-208ENST00000587361 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.61■■■■■ 4.25
YIF1B-208ENST00000587361 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
YIF1B-208ENST00000587361 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
YIF1B-208ENST00000587361 OSCARQ8IYS5 282 aa41.36■■■■■ 4.21
YIF1B-208ENST00000587361 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
YIF1B-208ENST00000587361 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
YIF1B-208ENST00000587361 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
YIF1B-208ENST00000587361 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.178e-8■■■■□ 20.1
YIF1B-208ENST00000587361 CUX1P39880 1505 aa41.13■■■■■ 4.17
YIF1B-208ENST00000587361 SOGA1O94964 1423 aa41.1■■■■■ 4.17
YIF1B-208ENST00000587361 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.09■■■■■ 4.17
YIF1B-208ENST00000587361 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.09■■■■■ 4.17
YIF1B-208ENST00000587361 WDR97A6NE52 1622 aa40.98■■■■■ 4.15
YIF1B-208ENST00000587361 TRIM41Q8WV44 630 aa40.98■■■■■ 4.15
YIF1B-208ENST00000587361 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
YIF1B-208ENST00000587361 CHD1O14646 1710 aa40.9■■■■■ 4.14
YIF1B-208ENST00000587361 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.78■■■■■ 4.12
YIF1B-208ENST00000587361 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.78■■■■■ 4.12
YIF1B-208ENST00000587361 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.78■■■■■ 4.12
YIF1B-208ENST00000587361 FBLN2P98095 1184 aa40.75■■■■■ 4.11
YIF1B-208ENST00000587361 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.75■■■■■ 4.11
YIF1B-208ENST00000587361 GRIN2BQ13224 1484 aa40.72■■■■■ 4.11
YIF1B-208ENST00000587361 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
YIF1B-208ENST00000587361 ARHGEF11O15085 1522 aa40.7■■■■■ 4.11
YIF1B-208ENST00000587361 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.68■■■■■ 4.1
YIF1B-208ENST00000587361 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.63■■■■■ 4.09
YIF1B-208ENST00000587361 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.62■■■■■ 4.09
YIF1B-208ENST00000587361 TOP2BQ02880 1626 aa40.62■■■■■ 4.09
YIF1B-208ENST00000587361 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.62■■■■■ 4.09
YIF1B-208ENST00000587361 PBRM1Q86U86 1689 aa40.61■■■■■ 4.09
YIF1B-208ENST00000587361 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.58■■■■■ 4.09
YIF1B-208ENST00000587361 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
YIF1B-208ENST00000587361 SYNJ2O15056 1496 aa40.55■■■■■ 4.08
YIF1B-208ENST00000587361 SYNJ1O43426 1573 aa40.54■■■■■ 4.08
YIF1B-208ENST00000587361 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.45■■■■■ 4.07
YIF1B-208ENST00000587361 ARAP1Q96P48 1450 aa40.32■■■■■ 4.05
YIF1B-208ENST00000587361 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.32■■■■■ 4.05
YIF1B-208ENST00000587361 ADAMTS12P58397 1594 aa40.24■■■■■ 4.03
YIF1B-208ENST00000587361 GRIN2AQ12879 1464 aa40.2■■■■■ 4.03
YIF1B-208ENST00000587361 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.2■■■■■ 4.03
YIF1B-208ENST00000587361 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.14■■■■■ 4.02
YIF1B-208ENST00000587361 NUP160Q12769 1436 aa40.06■■■■■ 4
YIF1B-208ENST00000587361 CEP170Q5SW79 1584 aa40.02■■■■■ 4
YIF1B-208ENST00000587361 SHROOM2Q13796 1616 aa39.85■■■■□ 3.97
YIF1B-208ENST00000587361 KIF27Q86VH2 1401 aa39.82■■■■□ 3.97
YIF1B-208ENST00000587361 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.8■■■■□ 3.96
YIF1B-208ENST00000587361 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
YIF1B-208ENST00000587361 IGF1RP08069 1367 aa39.72■■■■□ 3.95
YIF1B-208ENST00000587361 CUL7Q14999 1698 aa39.7■■■■□ 3.95
YIF1B-208ENST00000587361 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.66■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms