RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579889.1

NFE2L1-209, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, humanhuman

TSL 3

Gene NFE2L1, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L1-209ENST00000579889 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.45■■■□□ 2.47
NFE2L1-209ENST00000579889 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.12■■□□□ 1.93
NFE2L1-209ENST00000579889 ABCC9O60706 1549 aa26.64■■□□□ 1.85
NFE2L1-209ENST00000579889 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.6■■□□□ 1.69
NFE2L1-209ENST00000579889 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.55■■□□□ 1.68
NFE2L1-209ENST00000579889 NACADO15069 1562 aa25.55■■□□□ 1.68
NFE2L1-209ENST00000579889 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NFE2L1-209ENST00000579889 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.35■■□□□ 1.65
NFE2L1-209ENST00000579889 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.2■■□□□ 1.62
NFE2L1-209ENST00000579889 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NFE2L1-209ENST00000579889 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.98■■□□□ 1.59
NFE2L1-209ENST00000579889 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
NFE2L1-209ENST00000579889 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.79■■□□□ 1.56
NFE2L1-209ENST00000579889 SCRIBQ14160 1630 aa24.72■■□□□ 1.55
NFE2L1-209ENST00000579889 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.56■■□□□ 1.52
NFE2L1-209ENST00000579889 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.54■■□□□ 1.52
NFE2L1-209ENST00000579889 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.42■■□□□ 1.5
NFE2L1-209ENST00000579889 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NFE2L1-209ENST00000579889 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.09■■□□□ 1.45
NFE2L1-209ENST00000579889 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.96■■□□□ 1.43
NFE2L1-209ENST00000579889 SMARCA4P51532 1647 aa23.64■■□□□ 1.38
NFE2L1-209ENST00000579889 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
NFE2L1-209ENST00000579889 NCAPD3P42695 1498 aa23.57■■□□□ 1.36
NFE2L1-209ENST00000579889 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.55■■□□□ 1.36
NFE2L1-209ENST00000579889 SMARCA2P51531 1590 aa23.53■■□□□ 1.36
NFE2L1-209ENST00000579889 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.45■■□□□ 1.34
NFE2L1-209ENST00000579889 HMGXB3Q12766 1538 aa23.43■■□□□ 1.34
NFE2L1-209ENST00000579889 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.41■■□□□ 1.34
NFE2L1-209ENST00000579889 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
NFE2L1-209ENST00000579889 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
NFE2L1-209ENST00000579889 WIZO95785 1651 aa23.26■■□□□ 1.31
NFE2L1-209ENST00000579889 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NFE2L1-209ENST00000579889 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NFE2L1-209ENST00000579889 NESP48681 1621 aa23■■□□□ 1.27
NFE2L1-209ENST00000579889 ERCC6Q03468 1493 aa22.99■■□□□ 1.27
NFE2L1-209ENST00000579889 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.96■■□□□ 1.27
NFE2L1-209ENST00000579889 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.89■■□□□ 1.25
NFE2L1-209ENST00000579889 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.83■■□□□ 1.25
NFE2L1-209ENST00000579889 CUX2O14529 1486 aa22.79■■□□□ 1.24
NFE2L1-209ENST00000579889 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.73■■□□□ 1.23
NFE2L1-209ENST00000579889 CFTRP13569 1480 aa22.71■■□□□ 1.23
NFE2L1-209ENST00000579889 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.7■■□□□ 1.22
NFE2L1-209ENST00000579889 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NFE2L1-209ENST00000579889 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.6■■□□□ 1.21
NFE2L1-209ENST00000579889 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.6■■□□□ 1.21
NFE2L1-209ENST00000579889 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.58■■□□□ 1.2
NFE2L1-209ENST00000579889 PRDM2Q13029 1718 aa22.52■■□□□ 1.2
NFE2L1-209ENST00000579889 WDR62O43379 1518 aa22.5■■□□□ 1.19
NFE2L1-209ENST00000579889 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NFE2L1-209ENST00000579889 ABCC8Q09428 1581 aa22.26■■□□□ 1.15
NFE2L1-209ENST00000579889 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.24■■□□□ 1.15
NFE2L1-209ENST00000579889 TOPBP1Q92547 1522 aa22.22■■□□□ 1.15
NFE2L1-209ENST00000579889 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.19■■□□□ 1.14
NFE2L1-209ENST00000579889 IFT140Q96RY7 1462 aa22.13■■□□□ 1.13
NFE2L1-209ENST00000579889 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
NFE2L1-209ENST00000579889 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NFE2L1-209ENST00000579889 SYNJ1O43426 1573 aa22.01■■□□□ 1.11
NFE2L1-209ENST00000579889 CUX1P39880 1505 aa22.01■■□□□ 1.11
NFE2L1-209ENST00000579889 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NFE2L1-209ENST00000579889 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.98■■□□□ 1.11
NFE2L1-209ENST00000579889 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
NFE2L1-209ENST00000579889 SOGA1O94964 1423 aa21.97■■□□□ 1.11
NFE2L1-209ENST00000579889 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.96■■□□□ 1.11
NFE2L1-209ENST00000579889 TOP2BQ02880 1626 aa21.96■■□□□ 1.11
NFE2L1-209ENST00000579889 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.93■■□□□ 1.1
NFE2L1-209ENST00000579889 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NFE2L1-209ENST00000579889 TRIM41Q8WV44 630 aa21.9■■□□□ 1.1
NFE2L1-209ENST00000579889 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
NFE2L1-209ENST00000579889 OSCARQ8IYS5 282 aa21.87■■□□□ 1.09
NFE2L1-209ENST00000579889 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NFE2L1-209ENST00000579889 WDR97A6NE52 1622 aa21.83■■□□□ 1.08
NFE2L1-209ENST00000579889 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.75■■□□□ 1.07
NFE2L1-209ENST00000579889 GRIN2BQ13224 1484 aa21.71■■□□□ 1.07
NFE2L1-209ENST00000579889 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.71■■□□□ 1.07
NFE2L1-209ENST00000579889 FBLN2P98095 1184 aa21.7■■□□□ 1.06
NFE2L1-209ENST00000579889 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.68■■□□□ 1.06
NFE2L1-209ENST00000579889 CHD1O14646 1710 aa21.66■■□□□ 1.06
NFE2L1-209ENST00000579889 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
NFE2L1-209ENST00000579889 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.65■■□□□ 1.06
NFE2L1-209ENST00000579889 PBRM1Q86U86 1689 aa21.63■■□□□ 1.05
NFE2L1-209ENST00000579889 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NFE2L1-209ENST00000579889 SYNJ2O15056 1496 aa21.58■■□□□ 1.05
NFE2L1-209ENST00000579889 EEA1Q15075 1411 aa21.54■■□□□ 1.04
NFE2L1-209ENST00000579889 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.51■■□□□ 1.03
NFE2L1-209ENST00000579889 KIF27Q86VH2 1401 aa21.51■■□□□ 1.03
NFE2L1-209ENST00000579889 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.5■■□□□ 1.03
NFE2L1-209ENST00000579889 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE2L1-209ENST00000579889 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE2L1-209ENST00000579889 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE2L1-209ENST00000579889 ARHGEF11O15085 1522 aa21.45■■□□□ 1.02
NFE2L1-209ENST00000579889 ADAMTS12P58397 1594 aa21.45■■□□□ 1.02
NFE2L1-209ENST00000579889 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NFE2L1-209ENST00000579889 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.45■■□□□ 1.02
NFE2L1-209ENST00000579889 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NFE2L1-209ENST00000579889 GRIN2AQ12879 1464 aa21.42■■□□□ 1.02
NFE2L1-209ENST00000579889 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.42■■□□□ 1.02
NFE2L1-209ENST00000579889 CUL7Q14999 1698 aa21.34■■□□□ 1.01
NFE2L1-209ENST00000579889 KIF21BO75037 1637 aa21.34■■□□□ 1.01
NFE2L1-209ENST00000579889 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.34■■□□□ 1.01
NFE2L1-209ENST00000579889 IGF1RP08069 1367 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms