Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL11Q9NVR0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms