Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.56■□□□□ 0.562e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.472e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.473e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB6-202ENST00000571309 583 ntTSL 315.22■□□□□ 0.032e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBX1-202ENST00000467617 1871 ntTSL 214.84□□□□□ -0.033e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB6-204ENST00000575643 666 ntTSL 214.55□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.122e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 GAGE1-201ENST00000381700 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 COPZ1-202ENST00000455864 880 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 GAGE1-203ENST00000610680 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 COPZ1-201ENST00000262061 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-210ENST00000590258 2679 ntTSL 210.28□□□□□ -0.762e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 COPZ1-209ENST00000550171 1026 ntTSL 210.25□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.092e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-218ENST00000591906 936 ntTSL 37.98□□□□□ -1.132e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-206ENST00000587382 2079 ntTSL 37.62□□□□□ -1.192e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 GAGE1-202ENST00000381709 3129 ntTSL 27.5□□□□□ -1.212e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.332e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-213ENST00000590652 515 ntTSL 55.04□□□□□ -1.62e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.22e-11■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-223ENST00000545215 1340 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.222e-11■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 27.27□□□□□ -1.252e-11■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.076e-16■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS11-206ENST00000600027 944 ntTSL 512.34□□□□□ -0.432e-15■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS11-204ENST00000599167 1133 ntTSL 512.34□□□□□ -0.432e-15■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS11-207ENST00000601216 602 ntTSL 410.7□□□□□ -0.72e-15■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.752e-15■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 29.01□□□□□ -0.972e-15■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-15■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.152e-15■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 37.8□□□□□ -1.162e-15■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.222e-15■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.344e-26■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPL-212ENST00000601449 1918 ntTSL 517.47■□□□□ 0.394e-26■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.274e-26■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPL-203ENST00000595164 2404 ntTSL 212.88□□□□□ -0.354e-26■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPL-204ENST00000595443 2122 ntTSL 211.42□□□□□ -0.584e-26■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPL-206ENST00000597731 3094 ntTSL 210.71□□□□□ -0.694e-26■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPL-202ENST00000388749 1952 ntTSL 510.32□□□□□ -0.764e-26■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPL-205ENST00000595804 588 ntTSL 29.48□□□□□ -0.894e-26■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 58.76□□□□□ -1.014e-26■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.888e-18■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.928e-18■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.268e-18■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.288e-18■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.358e-18■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 210.68□□□□□ -0.72e-11■■□□□ 12.5
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APOBEC3CQ9NRW3 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-28■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.442e-28■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-214ENST00000486085 955 ntTSL 34.84□□□□□ -1.632e-8■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.342e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 213.06□□□□□ -0.322e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.152e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 MAGEC2-201ENST00000247452 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.782e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.612e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.32e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.262e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 522.4■■□□□ 1.182e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.12e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 12e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.872e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)20.14■□□□□ 0.822e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.782e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.762e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 C9orf16-203ENST00000489240 573 ntTSL 319.3■□□□□ 0.683e-13■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 PRMT1-216ENST00000530361 866 ntTSL 319.16■□□□□ 0.662e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.622e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 PRMT1-209ENST00000527866 968 ntTSL 218.81■□□□□ 0.62e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 AKR1A1-208ENST00000476957 910 ntTSL 318.69■□□□□ 0.582e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 318.48■□□□□ 0.552e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)18.45■□□□□ 0.542e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.532e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 AKR1A1-205ENST00000473038 948 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-25■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-25■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 215.37■□□□□ 0.052e-25■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 AKR1A1-213ENST00000497973 667 ntTSL 212.74□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 AKR1A1-206ENST00000475919 630 ntTSL 212.43□□□□□ -0.422e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-25■■□□□ 12.4
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