RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489240.1

C9orf16-203, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf16, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-203ENST00000489240 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.66■■■■■ 4.42
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C9orf16-203ENST00000489240 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.35■■■■□ 3.25
C9orf16-203ENST00000489240 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.27■■■■□ 3.24
C9orf16-203ENST00000489240 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.19■■■■□ 3.22
C9orf16-203ENST00000489240 NACADO15069 1562 aa35.15■■■■□ 3.22
C9orf16-203ENST00000489240 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35■■■■□ 3.19
C9orf16-203ENST00000489240 SCRIBQ14160 1630 aa34.37■■■■□ 3.09
C9orf16-203ENST00000489240 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.31■■■■□ 3.08
C9orf16-203ENST00000489240 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.16■■■■□ 3.06
C9orf16-203ENST00000489240 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.88■■■■□ 3.01
C9orf16-203ENST00000489240 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.67■■■□□ 2.98
C9orf16-203ENST00000489240 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.1■■■□□ 2.89
C9orf16-203ENST00000489240 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
C9orf16-203ENST00000489240 SMARCA4P51532 1647 aa32.97■■■□□ 2.87
C9orf16-203ENST00000489240 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
C9orf16-203ENST00000489240 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.87■■■□□ 2.85
C9orf16-203ENST00000489240 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
C9orf16-203ENST00000489240 WIZO95785 1651 aa32.62■■■□□ 2.81
C9orf16-203ENST00000489240 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.61■■■□□ 2.81
C9orf16-203ENST00000489240 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.59■■■□□ 2.81
C9orf16-203ENST00000489240 SMARCA2P51531 1590 aa32.58■■■□□ 2.81
C9orf16-203ENST00000489240 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
C9orf16-203ENST00000489240 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.5■■■□□ 2.79
C9orf16-203ENST00000489240 NCAPD3P42695 1498 aa32.36■■■□□ 2.77
C9orf16-203ENST00000489240 HMGXB3Q12766 1538 aa32.34■■■□□ 2.77
C9orf16-203ENST00000489240 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
C9orf16-203ENST00000489240 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
C9orf16-203ENST00000489240 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.14■■■□□ 2.74
C9orf16-203ENST00000489240 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.88■■■□□ 2.69
C9orf16-203ENST00000489240 PRDM2Q13029 1718 aa31.49■■■□□ 2.63
C9orf16-203ENST00000489240 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.46■■■□□ 2.63
C9orf16-203ENST00000489240 CFTRP13569 1480 aa31.46■■■□□ 2.63
C9orf16-203ENST00000489240 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.45■■■□□ 2.63
C9orf16-203ENST00000489240 NESP48681 1621 aa31.34■■■□□ 2.61
C9orf16-203ENST00000489240 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.15■■■□□ 2.58
C9orf16-203ENST00000489240 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.12■■■□□ 2.57
C9orf16-203ENST00000489240 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.1■■■□□ 2.57
C9orf16-203ENST00000489240 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.02■■■□□ 2.56
C9orf16-203ENST00000489240 ABCC8Q09428 1581 aa31■■■□□ 2.55
C9orf16-203ENST00000489240 ERCC6Q03468 1493 aa30.94■■■□□ 2.54
C9orf16-203ENST00000489240 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.54
C9orf16-203ENST00000489240 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.88■■■□□ 2.53
C9orf16-203ENST00000489240 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.83■■■□□ 2.53
C9orf16-203ENST00000489240 SYNJ1O43426 1573 aa30.81■■■□□ 2.52
C9orf16-203ENST00000489240 TOP2BQ02880 1626 aa30.8■■■□□ 2.52
C9orf16-203ENST00000489240 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.8■■■□□ 2.52
C9orf16-203ENST00000489240 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.8■■■□□ 2.52
C9orf16-203ENST00000489240 CUX1P39880 1505 aa30.79■■■□□ 2.52
C9orf16-203ENST00000489240 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
C9orf16-203ENST00000489240 TRIM41Q8WV44 630 aa30.74■■■□□ 2.51
C9orf16-203ENST00000489240 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
C9orf16-203ENST00000489240 TOPBP1Q92547 1522 aa30.73■■■□□ 2.51
C9orf16-203ENST00000489240 WDR62O43379 1518 aa30.68■■■□□ 2.5
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C9orf16-203ENST00000489240 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
C9orf16-203ENST00000489240 SOGA1O94964 1423 aa30.4■■■□□ 2.46
C9orf16-203ENST00000489240 CUX2O14529 1486 aa30.37■■■□□ 2.45
C9orf16-203ENST00000489240 WDR97A6NE52 1622 aa30.36■■■□□ 2.45
C9orf16-203ENST00000489240 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
C9orf16-203ENST00000489240 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.35■■■□□ 2.45
C9orf16-203ENST00000489240 IFT140Q96RY7 1462 aa30.33■■■□□ 2.45
C9orf16-203ENST00000489240 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.32■■■□□ 2.44
C9orf16-203ENST00000489240 EEA1Q15075 1411 aa30.21■■■□□ 2.43
C9orf16-203ENST00000489240 KIF27Q86VH2 1401 aa30.21■■■□□ 2.43
C9orf16-203ENST00000489240 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.16■■■□□ 2.42
C9orf16-203ENST00000489240 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.15■■■□□ 2.42
C9orf16-203ENST00000489240 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
C9orf16-203ENST00000489240 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
C9orf16-203ENST00000489240 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
C9orf16-203ENST00000489240 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.08■■■□□ 2.41
C9orf16-203ENST00000489240 PBRM1Q86U86 1689 aa30.07■■■□□ 2.41
C9orf16-203ENST00000489240 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
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C9orf16-203ENST00000489240 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.99■■■□□ 2.39
C9orf16-203ENST00000489240 GRIN2BQ13224 1484 aa29.96■■■□□ 2.39
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C9orf16-203ENST00000489240 IGF1RP08069 1367 aa29.93■■■□□ 2.38
C9orf16-203ENST00000489240 KIF21BO75037 1637 aa29.86■■■□□ 2.37
C9orf16-203ENST00000489240 PRXQ9BXM0 1461 aa29.81■■■□□ 2.36
C9orf16-203ENST00000489240 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
C9orf16-203ENST00000489240 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.8■■■□□ 2.36
C9orf16-203ENST00000489240 ADAMTS12P58397 1594 aa29.8■■■□□ 2.36
C9orf16-203ENST00000489240 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.79■■■□□ 2.36
C9orf16-203ENST00000489240 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf16-203ENST00000489240 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.74■■■□□ 2.35
C9orf16-203ENST00000489240 GOLGA3Q08378 1498 aa29.72■■■□□ 2.35
C9orf16-203ENST00000489240 SYNJ2O15056 1496 aa29.67■■■□□ 2.34
C9orf16-203ENST00000489240 CHD1O14646 1710 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf16-203ENST00000489240 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.6■■■□□ 2.33
C9orf16-203ENST00000489240 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.6■■■□□ 2.33
C9orf16-203ENST00000489240 GRIN2AQ12879 1464 aa29.57■■■□□ 2.32
C9orf16-203ENST00000489240 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
C9orf16-203ENST00000489240 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.55■■■□□ 2.32
C9orf16-203ENST00000489240 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
C9orf16-203ENST00000489240 FBLN2P98095 1184 aa29.51■■■□□ 2.31
C9orf16-203ENST00000489240 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.47■■■□□ 2.31
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