Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRC4Q9NPP4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms