Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms