Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR55Q9H6Y2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms