Protein–RNA interactions for Protein: Q9H361

PABPC3, Polyadenylate-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC3Q9H361 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PABPC3Q9H361 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC3Q9H361 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms