Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM14BQ9BX40 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms