Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BICD1Q96G01 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BICD1Q96G01 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BICD1Q96G01 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms