Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
BICD1Q96G01 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BICD1Q96G01 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
BICD1Q96G01 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
BICD1Q96G01 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
BICD1Q96G01 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BICD1Q96G01 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BICD1Q96G01 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BICD1Q96G01 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
BICD1Q96G01 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
BICD1Q96G01 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BICD1Q96G01 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
BICD1Q96G01 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
BICD1Q96G01 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BICD1Q96G01 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BICD1Q96G01 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
BICD1Q96G01 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICD1Q96G01 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
BICD1Q96G01 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BICD1Q96G01 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BICD1Q96G01 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
BICD1Q96G01 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICD1Q96G01 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BICD1Q96G01 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICD1Q96G01 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BICD1Q96G01 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BICD1Q96G01 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BICD1Q96G01 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BICD1Q96G01 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BICD1Q96G01 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
BICD1Q96G01 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BICD1Q96G01 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BICD1Q96G01 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BICD1Q96G01 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BICD1Q96G01 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BICD1Q96G01 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BICD1Q96G01 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BICD1Q96G01 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BICD1Q96G01 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BICD1Q96G01 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
BICD1Q96G01 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BICD1Q96G01 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BICD1Q96G01 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
BICD1Q96G01 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BICD1Q96G01 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICD1Q96G01 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICD1Q96G01 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BICD1Q96G01 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BICD1Q96G01 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BICD1Q96G01 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
BICD1Q96G01 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BICD1Q96G01 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BICD1Q96G01 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BICD1Q96G01 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BICD1Q96G01 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BICD1Q96G01 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BICD1Q96G01 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BICD1Q96G01 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BICD1Q96G01 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BICD1Q96G01 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BICD1Q96G01 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICD1Q96G01 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICD1Q96G01 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
BICD1Q96G01 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
BICD1Q96G01 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BICD1Q96G01 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BICD1Q96G01 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BICD1Q96G01 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
BICD1Q96G01 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BICD1Q96G01 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BICD1Q96G01 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
BICD1Q96G01 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BICD1Q96G01 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BICD1Q96G01 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BICD1Q96G01 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BICD1Q96G01 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BICD1Q96G01 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BICD1Q96G01 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BICD1Q96G01 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BICD1Q96G01 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BICD1Q96G01 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BICD1Q96G01 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BICD1Q96G01 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BICD1Q96G01 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BICD1Q96G01 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BICD1Q96G01 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BICD1Q96G01 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BICD1Q96G01 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BICD1Q96G01 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
BICD1Q96G01 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BICD1Q96G01 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
BICD1Q96G01 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
BICD1Q96G01 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
BICD1Q96G01 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
BICD1Q96G01 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
BICD1Q96G01 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
BICD1Q96G01 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
BICD1Q96G01 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BICD1Q96G01 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BICD1Q96G01 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms